刺客信条奥德赛全结局主要有3条线，分别是神教线、神器线、家庭线，玩家在游戏内关节剧情的选择，就会影响到结局的发展。神教线和神器线的结局是固定，而家庭线则会根据主角的选择不同，两个阶段的提示，充分利用，会出现略有不同的结果。
1.神教线
神教最一开始应该是一个"混乱中立"的角色，通过一定的混乱推进文明发展。之后失控开始变成了"守序邪恶"在之后愈演愈烈，失去控制变成了"混乱邪恶"。也就是说本作的"秩序神教"其实比较像"刺客组织"，主角清除了极端刺客势力，成就了有秩序的神教。
2.神器线
四大神器贯穿游戏始末，建议玩家在有一定的战斗实力之后再去探索神器线。
3.家庭线
主角的成长，和亲朋的相关剧情。这个线有很多分支，其中家族成员的存活决定了玩家能否达成最好或是最坏的结局。最好的结局之达成条件是所有家族成员活到最后。最坏的结局之达成条件是杀死所有家族成员。
